هي إحدى الشعب التي تُعنى بمراقبة وتقييم الأداء الإداري والمالي لضمان الالتزام بالقوانين والتعليمات النافذة، وتحقيق الشفافية والنزاهة في العمل وترتبط بعميد الكلية يترأس الشعبة السيد هيثم عبد الرزاق 

مهام شعبة التدقيق والرقابة الداخلية

 * تدقيق كافة المستندات القابلة للصرف ومستندات القيد

 * تدقيق رواتب المنتسبين الصباحي والمسائي والمحاضرات الاحتياطية

 * تدقيق جميع الموازين المراجعة والمطابقة للكشوفات البنك ومتابعة الصكوك المحررة والموقوفة

 * متابعة لجنة المشتريات في الكلية

* مطابقة وتدقيق الترحيلات للمستندات الادخال والاخراج المخزني الى سجلات ومتابعة الجرد ومطابقة في النهاية السنة المالية

 * تدقيق الترقيات والعلاوات للموظفين والتدريسيين وتدقيق الترقيات العلمية

 * تدقيق دفاتر التقاعد للمنتسبين المحالين على التقاعد

 * تدقيق الاستمرارية للمنتسبين وقاعدة البيانات ومطابقة الميلاد

 * يتم اعداد تقرير شهري عن اعمال الشعبة وبشكل الشهري وارسال نسخه لرئاسة الجامعة

* متابعة التقارير الديوان الرقابة المالية